Beasiswa Putra-Putri Papua adalah program beasiswa kepada putra-putri asli papua yang berasal dari Kota dan Kabupaten Sorong yang ingin melanjutkan pendidikan di SMA Averos. Melalui program beasiswa ini peserta didik dibebaskan dari seluruh biaya sekolah selama tiga tahun ajaran (hingga kelulusan). Syarat mendaftar beasiswa Putra-Putri Papua adalah:

1. Bermarga Asli Papua,

2. Ibu kandung adalah Orang Asli Papua, atau

3. Bapak kandung adalah Orang Asli Papua.

4. Surat Keterangan Berkelakuan Baik dari SMP asal.